Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m0.841s user 0m0.136s sys 0m0.072s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0: 865 spheres. 180. 180. 180. 180. 180. 188. 188. 189. 189. 189. 195. 195. 197. 197. 197. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 203. 203. 203. 203. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 205. 214. 214. 215. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 217. 217. 217. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 256. 258. 260. 260. 260. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 268. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 280. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 282. 282. 282. 283. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 294. 321. 321. 321. 321. 321. 321. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 322. 323. 323. 323. 323. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 348. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 351. 351. 351. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 358. 358. 358. 358. 358. 358. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 359. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 360. 364. 364. 364. 364. 364. 364. 365. 365. 365. 366. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 368. 384. 386. 386. 386. 386. 387. 387. 387. 387. 387. 387. 387. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 402. 402. 402. 404. 404. 408. 409. 409. 413. 413. 413. 413. 413. 414. 414. 414. 414. 414. 414. 414. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 418. 418. 420. 421. 421. 421. 421. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 422. 423. 423. 423. 424. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 427. 429. 429. 429. 429. 429. 429. 429. 430. 431. 431. 431. 431. 431. 431. 432. 432. 433. 433. 433. 436. 436. 436. 439. 439. 440. 440. 440. 440. 440. 440. 440. 441. 441. 443. 443. 444. 444. 444. 444. 444. 444. 444. 444. 447. 447. 447. 447. 447. 447. 447. 447. 447. 447. 447. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 448. 449. 449. 449. 449. 449. 449. 449. 449. 449. 450. 451. 451. 451. 451. 451. 451. 451. 451. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 453. 453. 453. 453. 465. 465. 467. 467. 467. 467. 469. 476. 477. 478. 478. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 480. 612. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 614. 614. 614. 614. 617. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 634. 635. 636. 637. 637. 637. 638. 639. 639. 639. 639. 642. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 644. 644. 644. 644. 644. 644. 645. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 646. 666. 672. 674. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 676. 676. 676. 678. 678. 678. 678. 678. 682. 682. 682. 682. 682. 683. 683. 683. 683. 683. 684. 685. 685. 686. 691. 691. 691. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 698. 698. 698. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 703. 703. 703. 703. 752. 753. 753. 753. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 764. 765. 765. 765. 765. 765. 765. 765. 765. 765. 765. 765. 765. 769. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 770. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 771. 772. 772. 772. 772. 772. 772. 772. 772. 772. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 16m50.358s user 15m20.586s sys 0m0.238s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 30m29.621s user 21m59.148s sys 0m0.063s