Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m1.418s user 0m0.236s sys 0m0.143s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1515 spheres. 189. 189. 189. 191. 191. 191. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 198. 199. 199. 199. 202. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 205. 205. 205. 205. 205. 205. 205. 205. 205. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 209. 209. 209. 209. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 211. 211. 211. 212. 212. 212. 215. 215. 215. 215. 215. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 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Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 18m47.892s user 15m33.403s sys 0m0.071s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 22m25.051s user 22m14.679s sys 0m0.077s