Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m26.380s user 0m0.330s sys 0m0.122s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1413 spheres. 121. 121. 122. 122. 122. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 196. 197. 199. 199. 199. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 201. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 216. 217. 217. 217. 217. 221. 221. 221. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 226. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 228. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 231. 231. 231. 231. 231. 231. 231. 231. 231. 231. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 234. 234. 234. 234. 234. 234. 235. 235. 237. 237. 237. 237. 237. 240. 240. 240. 240. 240. 245. 245. 245. 245. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 251. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 255. 258. 258. 258. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 263. 263. 263. 263. 263. 266. 266. 266. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 280. 340. 343. 343. 343. 344. 344. 344. 344. 344. 344. 344. 344. 344. 344. 344. 345. 345. 345. 345. 345. 345. 345. 345. 345. 345. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 346. 347. 347. 348. 348. 348. 348. 348. 348. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 350. 360. 362. 362. 362. 362. 374. 374. 374. 374. 374. 374. 374. 374. 374. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 382. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 386. 386. 386. 386. 387. 387. 387. 387. 387. 387. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 532. 532. 532. 532. 535. 535. 535. 535. 535. 535. 536. 536. 537. 540. 540. 540. 540. 540. 540. 540. 559. 559. 568. 569. 569. 569. 569. 569. 569. 569. 569. 569. 569. 569. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 570. 573. 573. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 574. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 645. 647. 647. 647. 650. 650. 650. 650. 650. 651. 651. 653. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 657. 660. 660. 664. 664. 665. 665. 665. 665. 667. 668. 668. 668. 668. 673. 674. 674. 674. 674. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 676. 676. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 688. 688. 688. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 789. 789. 802. 802. 802. 802. 802. 802. 802. 802. 806. 806. 806. 807. 807. 807. 807. 816. 816. 816. 816. 822. 822. 822. 822. 822. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 824. 828. 828. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 838. 841. 841. 841. 841. 842. 842. 842. 842. 842. 842. 842. 842. 842. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 848. 849. 849. 849. 850. 851. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 853. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 856. 857. 857. 857. 857. 858. 859. 859. 859. 859. 859. 859. 859. 859. 859. 859. 859. 859. 864. 864. 864. 867. 867. 867. 867. 867. 867. 867. 867. 867. 867. 867. 870. 870. 873. 873. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 880. 882. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 887. 887. 888. 888. 889. 889. 890. 890. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 895. 897. 897. 897. 897. 897. 897. 897. 897. 899. 899. 899. 899. 899. 899.1142.1142.1142.1142.1142.1142.1142.1142.1178.1178.1178.1178.1178.1178.1178.1178.1178.1178.1178.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1184.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1186.1186.1186.1186.1189.1190.1190.1190.1190.1190.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1191.1192.1197.1200.1200.1200.1200.1200.1200.1210.1210.1210.1210.1213.1213.1213.1213.1213.1213.1213.1213.1213.1217.1223.1225.1225.1225.1225.1225.1225.1225.1225.1225.1226.1226.1226.1228.1228.1228.1228.1228.1228.1228.1228.1228.1228.1228.1231.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1233.1233.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1234.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1235.1236.1236.1236.1236.1236.1236.1236.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1237.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1256.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1258.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1259.1260.1260.1260.1263.1263.1264.1264.1264.1264.1264.1264.1264.1264.1264.1274.1276.1276.1276.1276.1276.1276.1276.1276.1276.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1277.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1292.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1293.1294.1294.1294.1294.1294.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1297.1298.1298.1298.1298.1298.1298.1300.1300.1300.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1301.1310.1311.1311.1311.1320.1321.1321.1321.1321.1321.1321.1323.1323.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 26m38.353s user 25m30.019s sys 0m0.063s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 46m44.783s user 36m16.005s sys 0m0.047s