Creating binding-site residue list
Creating molecular surface

real	0m1.534s
user	0m0.286s
sys	0m0.150s
Creating sphgen spheres
 Enter name of sphere cluster file:
 Enter cluster number to process (<0 = all):  Generate surfaces as well as pdb files (<N>/Y)?  Enter name for output PDB file name:

Cluster  0:2289 spheres.
 248. 248. 248. 248. 248. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 254. 258. 259. 259. 259. 261. 261. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 273. 277. 278. 287. 287. 287. 311. 318. 318. 318. 318. 318. 318. 318. 322. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 327. 327. 327. 329. 330. 330. 330. 330. 330. 330. 330. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 331. 332. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 336. 336. 338. 344. 344. 344. 344. 344. 344. 346. 353. 353. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 354. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 355. 356. 356. 356. 356. 356. 356. 356. 356. 356. 356. 360. 360. 360. 360. 361. 361. 362. 362. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 366. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 368. 368. 368. 369. 369. 370. 370. 370. 370. 370. 370. 370. 370. 370. 370. 370. 371. 371. 371. 371. 373. 373. 373. 373. 373. 373. 374. 374. 374. 376. 376. 376. 376. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 378. 378. 378. 383. 383. 383. 383. 383. 383. 383. 383. 383. 383. 383. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 390. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 391. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 396. 396. 396. 396. 398. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 402. 404. 404. 404. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 405. 406. 406. 406. 406. 406. 406. 406. 407. 407. 407. 407. 407. 407. 469. 469. 473. 473. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 484. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 487. 488. 491. 491. 491. 491. 491. 491. 491. 491. 491. 494. 494. 494. 494. 494. 494. 494. 494. 494. 494. 495. 495. 495. 495. 495. 495. 496. 496. 496. 498. 498. 503. 503. 503. 503. 503. 503. 503. 503. 503. 503. 506. 512. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 513. 515. 515. 515. 515. 515. 515. 515. 515. 517. 517. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 520. 521. 521. 521. 521. 521. 521. 521. 521. 521. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 522. 523. 523. 523. 523. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 524. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 525. 528. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 530. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 531. 533. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 536. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 539. 540. 540. 542. 542. 542. 542. 543. 544. 544. 545. 545. 545. 545. 545. 545. 548. 548. 548. 548. 548. 549. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 554. 554. 554. 554. 554. 554. 554. 554. 554. 554. 554. 557. 557. 557. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 559. 561. 561. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 565. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 579. 579. 579. 579. 579. 579. 579. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 586. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 588. 588. 588. 588. 588. 588. 588. 588. 588. 588. 588. 588. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 809. 809. 819. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 821. 830. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 843. 843. 843. 843. 843. 843. 843. 843. 843. 843. 849. 849. 849. 853. 854. 854. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 857. 857. 857. 857. 857. 857. 857. 857. 857. 857. 857. 857. 865. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 870. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 884. 885. 885. 885. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 889. 929. 929. 929. 929. 929. 929. 929. 929. 929. 929. 929. 929. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 930. 933. 933. 933. 933. 940. 940. 940. 940. 940. 940. 943. 943. 943. 943. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 945. 945. 945. 945. 945. 945. 945. 945. 945. 945. 945. 945. 946. 947. 947. 947. 947. 947. 947. 947. 947. 947. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 951. 951. 951. 952. 952. 952. 952. 952. 957. 957. 957. 957. 957. 957. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 958. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 959. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 960. 961. 961. 961. 961. 961. 961. 961. 961. 961. 961. 961. 962. 963. 963. 965. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 966. 968. 970. 970. 970. 970. 970. 971. 972. 972. 973. 973. 973. 974. 974. 974. 974. 974. 974. 974. 974. 974. 974. 974. 985. 987. 996. 996. 996. 997. 997. 997. 997. 997. 997. 997. 997. 997. 997. 997.1002.1002.1003.1004.1008.1009.1009.1011.1011.1011.1011.1011.1012.1012.1012.1013.1013.1013.1013.1013.1015.1025.1025.1026.1031.1038.1038.1038.1040.1042.1042.1043.1045.1048.1049.1049.1049.1050.1050.1050.1050.1051.1051.1051.1051.1052.1052.1052.1052.1052.1052.1052.1052.1052.1052.1052.1091.1091.1091.1092.1092.1093.1093.1098.1098.1098.1100.1100.1108.1108.1108.1108.1108.1110.1112.1112.1112.1112.1112.1112.1115.1115.1115.1115.1115.1115.1115.1116.1116.1116.1116.1116.1116.1117.1117.1117.1117.1117.1117.1118.1118.1118.1118.1118.1118.1118.1123.1124.1125.1125.1125.1125.1125.1125.1126.1126.1126.1126.1126.1126.1126.1126.1126.1126.1126.1126.1131.1131.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1133.1135.1135.1139.1139.1139.1139.1139.1139.1139.1139.1139.1140.1140.1140.1140.1140.1140.1142.1143.1143.1148.1148.1148.1148.1148.1148.1148.1148.1148.1148.1148.1148.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1149.1150.1150.1158.1159.1159.1159.1159.1159.1159.1159.1159.1159.1159.1159.1159.1169.1633.1633.1633.1633.1633.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1634.1653.1653.1653.1653.1653.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1660.1661.1661.1661.1661.1664.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1666.1668.1668.1668.1668.1671.1671.1672.1672.1672.1673.1673.1673.1673.1673.1673.1673.1674.1674.1674.1674.1674.1675.1675.1675.1675.1675.1675.1675.1675.1675.1677.1677.1680.1680.1680.1680.1680.1680.1680.1680.1680.1680.1682.1682.1682.1682.1682.1682.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1689.1690.1690.1690.1690.1690.1690.1690.1690.1690.1690.1695.1695.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1696.1697.1697.1697.1697.1697.1698.1698.1698.1698.1698.1699.1699.1699.1699.1699.1699.1705.1705.1705.1706.1706.1706.1706.1706.1706.1706.1706.1706.1706.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1707.1715.1715.1717.1717.1717.1717.1717.1717.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1719.1720.1720.1721.1721.1721.1721.1723.1723.1723.1724.1724.1724.1724.1765.1765.1765.1766.1766.1766.1766.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1770.1772.1772.1772.1772.1772.1772.1772.1772.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1773.1774.1774.1774.1777.1777.1777.1777.1777.1781.1781.1781.1783.1783.1783.1783.1783.1786.1786.1786.1786.1786.1786.1786.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1788.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1790.1791.1803.1803.1806.1813.1813.1813.1813.1813.1813.1813.1813.1813.1820.1820.1820.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1823.1840.1840.1840.1840.1840.1840.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1844.1847.1850.1850.1850.1850.1850.1872.1872.1872.1872.1872.1872.1872.1872.1875.1875.1875.1875.1875.1876.1876.1876.1877.1877.1877.1877.1877.1877.1877.1878.1878.1878.1878.1878.1878.1878.FORTRAN STOP

Generating faster matching2 spheres for docking
 Enter name of sphere cluster file:
 Enter cluster number to process (<0 = all):  Generate surfaces as well as pdb files (<N>/Y)?  Enter name for output PDB file name:

Cluster  1:  45 spheres.
9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP

Coloring matching spheres
Creating box around spheres
Hydrogen solvent excluded grid being made
FORTRAN STOP

real	18m22.228s
user	17m5.416s
sys	0m0.170s
Heavy solvent excluded grid being made
FORTRAN STOP

real	29m14.726s
user	24m27.803s
sys	0m0.138s