Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m2.148s user 0m0.359s sys 0m0.308s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1098 spheres. 52. 52. 54. 54. 54. 54. 54. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 55. 79. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 82. 83. 83. 83. 85. 85. 85. 85. 85. 85. 86. 86. 86. 86. 86. 86. 86. 86. 86. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 240. 240. 240. 240. 244. 244. 246. 246. 246. 250. 250. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 253. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 398. 399. 399. 403. 403. 403. 403. 411. 412. 412. 412. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 413. 452. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 457. 457. 457. 457. 457. 457. 457. 457. 457. 457. 459. 459. 459. 459. 459. 459. 460. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 485. 488. 493. 493. 493. 493. 625. 625. 625. 625. 625. 625. 625. 625. 625. 625. 625. 629. 629. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 633. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 644. 644. 644. 644. 644. 644. 644. 648. 648. 649. 649. 649. 649. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 651. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 652. 653. 653. 653. 653. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 654. 657. 657. 658. 658. 658. 658. 658. 658. 658. 658. 661. 661. 662. 662. 662. 662. 663. 663. 663. 663. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 671. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 673. 674. 674. 674. 677. 677. 678. 678. 678. 680. 683. 683. 683. 686. 686. 687. 687. 687. 687. 687. 688. 688. 696. 696. 696. 696. 696. 696. 696. 696. 696. 697. 697. 697. 697. 697. 697. 697. 697. 698. 713. 713. 713. 713. 715. 715. 715. 716. 718. 718. 718. 718. 722. 722. 722. 722. 723. 723. 724. 724. 724. 724. 724. 724. 724. 725. 725. 725. 725. 770. 770. 770. 773. 774. 774. 774. 774. 774. 774. 774. 774. 777. 791. 791. 791. 791. 791. 791. 791. 791. 791. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 793. 793. 797. 797. 797. 797. 797. 800. 800. 800. 800. 815. 815. 816. 817. 817. 817. 817. 817. 817. 817. 817. 817. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 823. 823. 823. 823. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 839. 839. 849. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 861. 861. 861. 861. 861. 861. 863. 863. 863. 869. 869. 869. 869. 869. 871. 871. 871. 871. 872. 872. 872. 873. 873. 873. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 876. 876. 879. 879. 879. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 881. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 883. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 885. 886. 886. 886. 886. 886. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 889. 889. 889. 890. 890. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 891. 892. 892. 894. 894. 894. 901. 901. 901. 901. 901. 901. 901. 901. 901. 901. 901. 901. 903. 903. 903. 903. 903. 903. 903. 903. 903. 903. 903. 903. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 904. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 906. 917. 917. 917. 917. 917. 917. 917. 919.1018.1018.1018.1018.1018.1018.1024.1024.1024.1030.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1034.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1036.1037.1038.1039.1039.1041.1041.1041.1041.1041.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1042.1046.1047.1047.1047.1047.1048.1048.1048.1048.1048.1048.1048.1048.1048.1049.1049.1049.1049.1049.1049.1049.1051.1051.1051.1051.1051.1051.1051.1051.1051.1056.1056.1056.1056.1056.1056.1056.1056.1056.1056.1057.1057.1057.1057.1057.1057.1057.1057.1058.1058.1058.1058.1058.1058.1058.1058.1058.1058.1058.1059.1059.1059.1059.1059.1059.1059.1061.1061.1061.1061.1061.1061.1063.1063.1064.1064.1064.1065.1065.1065.1065.1065.1065.1065.1065.1065.1065.1065.1065.1067.1072.1072.1073.1073.1074.1076.1076.1078.1078.1078.1078.1078.1078.1078.1078.1079.1079.1079.1081.1081.1081.1081.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1089.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1288.1288.1288.1288.1288.1288.1288.1288.1288.1290.1290.1290.1322.1322.1322.1322.1322.1322.1322.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 23m36.522s user 23m36.062s sys 0m0.140s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 33m11.509s user 33m9.405s sys 0m0.147s