Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m1.502s user 0m0.222s sys 0m0.125s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1886 spheres. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 100. 112. 112. 112. 112. 112. 112. 112. 112. 112. 112. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 114. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 118. 118. 118. 118. 118. 118. 118. 118. 118. 118. 118. 118. 119. 122. 122. 122. 122. 123. 123. 123. 123. 124. 124. 124. 125. 125. 125. 125. 125. 127. 127. 130. 130. 131. 131. 131. 131. 137. 138. 138. 139. 139. 139. 139. 139. 144. 144. 144. 144. 144. 146. 146. 146. 146. 146. 148. 150. 150. 150. 150. 151. 151. 151. 152. 152. 152. 152. 152. 153. 153. 153. 153. 153. 154. 154. 154. 154. 154. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 165. 165. 166. 166. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 171. 171. 172. 173. 173. 173. 173. 173. 173. 173. 173. 173. 173. 173. 174. 174. 174. 174. 174. 174. 174. 174. 174. 174. 176. 176. 176. 176. 176. 176. 177. 177. 177. 177. 177. 177. 177. 182. 182. 182. 182. 182. 182. 184. 184. 184. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 192. 195. 195. 195. 195. 195. 197. 197. 200. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 202. 202. 202. 202. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 204. 209. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 212. 212. 213. 213. 213. 213. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 225. 225. 225. 225. 226. 226. 226. 226. 228. 230. 232. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 238. 239. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 461. 465. 465. 465. 465. 465. 465. 466. 466. 466. 471. 471. 471. 471. 471. 472. 472. 472. 473. 473. 473. 473. 473. 473. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 481. 481. 481. 481. 481. 481. 481. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 482. 483. 495. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 498. 499. 499. 499. 499. 499. 499. 499. 499. 505. 505. 505. 505. 505. 509. 509. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 512. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 517. 518. 518. 523. 523. 523. 523. 523. 523. 523. 523. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 526. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 528. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 542. 544. 544. 544. 544. 544. 544. 547. 547. 547. 547. 547. 547. 547. 549. 549. 549. 550. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 552. 553. 553. 553. 555. 556. 556. 556. 556. 556. 556. 556. 600. 601. 601. 601. 601. 601. 611. 611. 611. 617. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 619. 621. 623. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 628. 631. 634. 634. 634. 635. 635. 636. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 638. 638. 638. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 641. 648. 648. 648. 648. 648. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 651. 651. 651. 651. 651. 663. 663. 663. 663. 663. 663. 663. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 664. 668. 668. 668. 669. 669. 673. 673. 673. 673. 673. 676. 676. 676. 676. 676. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 685. 685. 685. 685. 685. 685. 686. 688. 688. 688. 688. 688. 688. 688. 688. 688. 688. 688. 688. 689. 689. 689. 689. 689. 689. 689. 689. 689. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 708. 712. 712. 713. 714. 714. 714. 715. 715. 716. 716. 716. 716. 716. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 717. 726. 726. 726. 726. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 728. 729. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 731. 732. 732. 732. 732. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 733. 735. 735. 735. 735. 735. 736. 736. 736. 739. 740. 740. 740. 740. 740. 740. 740. 740. 740. 741. 741. 741. 742. 742. 742. 743. 743. 743. 743. 743. 743. 743. 745. 745. 745. 745. 745. 745. 746. 746. 746. 746. 747. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 749. 751. 751. 754. 754. 755. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 759. 764. 764. 764. 764. 764. 764. 764. 764. 764. 764. 764. 773. 774. 774. 775. 775. 775. 775. 775. 775. 775. 775. 775. 775. 782. 782. 782. 782. 782. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 801. 802. 802. 802. 802. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 820. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 826. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 832. 969. 969. 970. 970. 970. 970. 970.1333.1333.1333.1333.1333.1333.1333.1335.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1336.1370.1370.1370.1370.1370.1370.1371.1371.1372.1372.1372.1372.1372.1372.1372.1372.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1373.1378.1378.1378.1378.1378.1379.1379.1379.1379.1379.1379.1379.1379.1380.1380.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1381.1382.1382.1384.1385.1385.1385.1385.1386.1386.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1387.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1388.1390.1390.1390.1390.1390.1393.1393.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1398.1398.1398.1401.1401.1401.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1402.1403.1404.1404.1404.1404.1404.1405.1405.1405.1405.1405.1410.1410.1410.1410.1411.1412.1412.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1414.1415.1415.1420.1420.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1421.1422.1422.1422.1422.1427.1427.1427.1430.1430.1430.1430.1430.1431.1431.1431.1431.1432.1432.1432.1433.1433.1434.1434.1434.1434.1434.1434.1439.1439.1439.1439.1440.1440.1441.1441.1441.1441.1441.1441.1442.1442.1442.1442.1442.1442.1442.1442.1442.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1453.1453.1453.1453.1453.1453.1453.1453.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1454.1455.1455.1455.1455.1455.1455.1455.1455.1455.1455.1455.1455.1458.1458.1458.1458.1458.1460.1460.1460.1460.1463.1463.1463.1464.1465.1465.1465.1465.1465.1465.1465.1494.1494.1494.1494.1494.1495.1495.1496.1497.1497.1497.1497.1497.1497.1497.1497.1499.1499.1499.1499.1499.1502.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1505.1506.1506.1506.1506.1506.1506.1508.1509.1510.1510.1510.1511.1549.1553.1555.1555.1555.1555.1555.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1557.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1573.1573.1573.1573.1573.1573.1573.1573.1573.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1574.1577.1577.1577.1577.1578.1578.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 16m54.023s user 15m29.297s sys 0m0.046s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 24m16.344s user 22m8.852s sys 0m0.042s