Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m1.393s user 0m0.257s sys 0m0.139s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1528 spheres. 101. 101. 101. 101. 101. 101. 101. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 102. 116. 116. 116. 119. 121. 121. 127. 127. 128. 128. 128. 128. 128. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 131. 132. 132. 132. 132. 132. 132. 133. 133. 133. 133. 134. 137. 138. 138. 138. 139. 139. 139. 139. 139. 139. 140. 140. 140. 140. 140. 145. 145. 167. 175. 175. 175. 175. 175. 175. 272. 272. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 274. 274. 274. 276. 277. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 280. 280. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 281. 287. 287. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 291. 301. 301. 301. 301. 302. 302. 302. 302. 302. 303. 303. 303. 303. 304. 304. 304. 304. 304. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 306. 306. 306. 307. 307. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 321. 321. 321. 321. 323. 323. 323. 323. 323. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 328. 329. 329. 329. 329. 329. 329. 329. 329. 329. 329. 330. 330. 330. 330. 330. 330. 330. 330. 330. 331. 338. 339. 340. 340. 341. 341. 341. 343. 344. 345. 345. 346. 346. 347. 347. 347. 347. 347. 347. 347. 348. 348. 348. 348. 348. 348. 348. 348. 348. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 349. 356. 356. 356. 356. 356. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 357. 358. 358. 358. 358. 360. 364. 365. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 368. 371. 372. 373. 373. 373. 373. 373. 373. 373. 373. 373. 375. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 378. 379. 379. 379. 379. 379. 379. 384. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 385. 392. 395. 399. 400. 400. 400. 400. 400. 406. 406. 406. 406. 406. 406. 406. 407. 407. 407. 407. 407. 407. 408. 408. 408. 408. 408. 410. 410. 410. 410. 410. 410. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 415. 417. 417. 619. 619. 619. 620. 620. 621. 621. 625. 625. 625. 625. 625. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 627. 628. 628. 628. 628. 628. 636. 636. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 645. 647. 648. 649. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 650. 651. 651. 652. 652. 652. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 666. 669. 670. 670. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 673. 674. 674. 674. 674. 674. 674. 674. 678. 680. 680. 680. 683. 683. 683. 683. 683. 683. 683. 692. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 695. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 699. 704. 704. 704. 704. 704. 704. 705. 706. 706. 706. 706. 706. 706. 706. 706. 706. 706. 772. 772. 777. 777. 777. 780. 780. 780. 780. 780. 780. 780. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 783. 784. 784. 784. 784. 784. 784. 784. 784. 784. 785. 785. 785. 785. 785. 788. 790. 790. 790. 790. 790. 800. 800. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 801. 802. 802. 802. 802. 802. 802. 803. 803. 803. 803. 803. 803. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 804. 809. 809. 809. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 816. 816. 816. 816. 816. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 831. 848. 848. 848. 848. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 852. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 855. 862. 863. 863. 867. 867. 867. 867. 869. 870. 871. 871. 871. 871. 871. 871. 871. 874. 874. 874. 875. 876. 876. 876. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 880. 880. 880. 880. 883. 883. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 886. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 894. 894. 894. 894. 894. 894. 894. 894. 895. 895. 895. 895. 895. 895. 895. 895. 895. 895. 895. 895. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 896. 898. 909. 909. 909. 914. 932. 932. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 933. 941. 941. 941. 941. 962. 962. 965. 965. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967. 967.1470.1470.1470.1470.1470.1470.1470.1492.1492.1492.1492.1496.1496.1498.1498.1500.1500.1500.1500.1500.1500.1500.1501.1501.1501.1501.1501.1501.1501.1501.1502.1502.1502.1502.1511.1512.1512.1512.1512.1512.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1513.1521.1521.1521.1521.1525.1525.1526.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1528.1536.1536.1536.1536.1540.1540.1540.1540.1540.1540.1540.1541.1541.1541.1541.1541.1541.1543.1543.1544.1544.1545.1545.1545.1545.1545.1545.1545.1545.1545.1545.1545.1545.1547.1550.1552.1554.1556.1556.1556.1556.1556.1562.1562.1562.1562.1563.1563.1563.1563.1563.1563.1563.1563.1563.1563.1563.1563.1564.1564.1564.1574.1574.1574.1574.1576.1576.1576.1576.1576.1576.1576.1576.1576.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1577.1612.1612.1613.1614.1614.1619.1619.1619.1619.1620.1621.1621.1621.1621.1621.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1624.1624.1624.1624.1625.1625.1625.1625.1625.1626.1626.1626.1626.1626.1626.1626.1626.1626.1626.1627.1627.1628.1628.1628.1628.1628.1628.1628.1628.1629.1630.1630.1630.1630.1637.1637.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1639.1642.1643.1643.1643.1646.1647.1647.1647.1647.1648.1648.1648.1648.1649.1649.1649.1649.1649.1649.1649.1649.1649.1650.1650.1652.1656.1662.1662.1662.1662.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1663.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1664.1669.1669.1669.1669.1671.1671.1671.1671.1671.1671.1671.1672.1672.1679.1679.1679.1681.1681.1681.1681.1681.1681.1681.1681.1681.1681.1681.1681.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1683.1688.1690.1690.1690.1691.1691.1691.1691.1691.1691.1691.1691.1704.1704.1704.1704.1704.1706.1707.1709.1709.1709.1710.1710.1710.1710.1710.1710.1710.1710.1710.1710.1711.1711.1711.1711.1711.1711.1711.1715.1715.1715.1715.1715.1715.1715.1715.1715.1715.1717.1717.1717.1717.1717.1717.1717.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 20m46.978s user 17m12.047s sys 0m0.376s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 24m26.654s user 24m25.532s sys 0m0.075s