Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m0.960s user 0m0.203s sys 0m0.087s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1599 spheres. 64. 64. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 75. 75. 75. 75. 75. 75. 75. 75. 75. 75. 79. 79. 79. 83. 83. 83. 83. 83. 88. 88. 88. 88. 89. 91. 91. 91. 91. 91. 91. 91. 91. 92. 92. 92. 92. 96. 96. 96. 96. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 97. 98. 103. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 104. 105. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 113. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 115. 115. 115. 120. 120. 120. 120. 123. 124. 124. 125. 125. 125. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 126. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 131. 132. 132. 132. 134. 134. 134. 134. 134. 135. 139. 139. 139. 139. 139. 139. 139. 139. 139. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 141. 141. 141. 141. 141. 141. 141. 141. 141. 141. 142. 142. 142. 142. 142. 142. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 154. 154. 154. 160. 160. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 161. 164. 164. 165. 166. 167. 167. 167. 167. 169. 169. 170. 170. 170. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 175. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 183. 184. 184. 189. 189. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 191. 191. 191. 191. 191. 191. 191. 191. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 195. 197. 198. 199. 199. 199. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 201. 201. 215. 215. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 220. 220. 223. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 225. 225. 225. 225. 225. 225. 236. 236. 236. 238. 238. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 243. 243. 243. 243. 243. 243. 243. 243. 244. 244. 244. 244. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 254. 256. 256. 257. 257. 259. 259. 259. 259. 259. 259. 259. 259. 259. 259. 260. 260. 260. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 264. 265. 265. 265. 265. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 269. 273. 274. 274. 274. 274. 275. 275. 275. 275. 275. 277. 277. 277. 277. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 278. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 279. 280. 280. 280. 280. 280. 280. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 289. 292. 294. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 298. 298. 298. 298. 298. 298. 304. 304. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 305. 310. 310. 310. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 312. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 318. 318. 318. 318. 318. 318. 318. 318. 318. 318. 321. 321. 321. 321. 321. 321. 369. 369. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 377. 380. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 384. 391. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 392. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 393. 394. 394. 394. 394. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 399. 400. 400. 400. 401. 402. 402. 402. 402. 402. 402. 404. 406. 406. 406. 406. 406. 406. 406. 406. 409. 409. 410. 413. 414. 414. 414. 414. 414. 415. 415. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 416. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 417. 421. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 425. 426. 426. 426. 426. 426. 426. 426. 426. 426. 427. 427. 427. 427. 427. 428. 428. 428. 430. 432. 432. 432. 432. 432. 433. 435. 435. 435. 435. 436. 436. 436. 436. 436. 436. 437. 437. 437. 437. 437. 437. 437. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 442. 443. 443. 443. 443. 443. 443. 444. 444. 444. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 450. 451. 451. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 452. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 456. 457. 457. 458. 460. 460. 460. 460. 460. 460. 461. 461. 461. 463. 463. 463. 466. 468. 468. 468. 468. 468. 468. 468. 468. 468. 468. 469. 469. 469. 469. 469. 473. 473. 473. 473. 473. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 474. 475. 475. 477. 477. 477. 477. 477. 483. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 529. 532. 532. 532. 532. 532. 532. 532. 532. 532. 545. 545. 545. 545. 545. 545. 545. 545. 545. 545. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 552. 553. 553. 556. 556. 557. 557. 557. 557. 557. 557. 557. 557. 557. 557. 557. 558. 559. 559. 559. 559. 561. 561. 561. 561. 561. 567. 567. 570. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 573. 574. 574. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 577. 577. 577. 577. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 579. 579. 579. 582. 583. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 585. 585. 585. 585. 585. 586. 586. 587. 587. 587. 589. 589. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 594. 594. 594. 598. 598. 598. 598. 598. 598. 598. 623. 640. 684. 684. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 686. 703. 703. 703. 703. 710. 711. 711. 711. 711. 711. 711. 711. 718. 720. 720. 720. 730. 730. 730. 730. 731. 731. 731. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 736. 738. 738. 738. 738. 772. 772. 781. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 782. 784. 784. 784. 790. 790. 790. 790. 790. 790. 790. 792. 798. 798. 798. 798. 798. 798. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 800. 801. 811. 811. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 812. 881. 881. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 888. 893. 893. 893. 893. 895. 895. 895. 895. 895. 896. 896. 896. 896. 897. 897. 897. 897. 897. 897. 903. 903. 908. 908. 908. 908. 908. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 918. 947. 947. 955. 956. 956. 956. 956. 956. 956. 957. 957. 957. 957. 957. 957. 957. 957. 957. 957. 957. 958. 958. 958. 958. 958. 964. 964. 966. 969. 976. 976. 976. 976. 976. 976. 985. 988. 988. 988. 988. 988. 988. 988. 988. 988.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 19m7.830s user 17m19.391s sys 0m0.085s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 28m17.244s user 24m40.855s sys 0m0.218s