Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m1.960s user 0m0.329s sys 0m0.188s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1533 spheres. 155. 160. 160. 160. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 162. 163. 163. 163. 163. 163. 163. 163. 163. 163. 163. 167. 167. 167. 167. 167. 167. 167. 167. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 168. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 169. 170. 170. 173. 174. 174. 174. 174. 175. 175. 175. 175. 177. 177. 177. 177. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 178. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 180. 181. 181. 181. 181. 181. 181. 182. 182. 184. 184. 184. 185. 185. 186. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 187. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 188. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 189. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 190. 191. 192. 192. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 195. 195. 197. 198. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 199. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 201. 202. 202. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 205. 205. 205. 205. 205. 206. 206. 206. 206. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 208. 208. 208. 209. 209. 209. 210. 211. 211. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 213. 216. 216. 216. 216. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 221. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 224. 224. 224. 224. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 244. 244. 244. 244. 246. 246. 246. 246. 246. 246. 246. 246. 246. 360. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 363. 364. 364. 365. 365. 365. 365. 365. 365. 365. 365. 365. 365. 365. 365. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 366. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 367. 368. 368. 368. 368. 368. 380. 380. 380. 380. 380. 380. 380. 380. 392. 392. 392. 392. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 394. 395. 395. 396. 396. 396. 396. 396. 396. 396. 396. 396. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 400. 401. 401. 401. 401. 402. 402. 403. 403. 403. 403. 403. 404. 497. 497. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 502. 502. 502. 503. 523. 523. 525. 525. 525. 525. 525. 526. 526. 526. 533. 533. 533. 533. 534. 534. 534. 534. 534. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 550. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 551. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 555. 556. 557. 557. 557. 557. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 558. 559. 559. 559. 559. 563. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 582. 621. 621. 621. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 623. 624. 624. 632. 632. 632. 632. 632. 636. 637. 637. 637. 637. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 642. 642. 642. 642. 642. 642. 647. 649. 649. 649. 649. 653. 653. 653. 653. 663. 663. 663. 663. 664. 664. 664. 666. 732. 732. 734. 734. 740. 755. 755. 755. 755. 755. 755. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 758. 758. 760. 760. 760. 761. 761. 761. 761. 762. 765. 766. 766. 769. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 775. 775. 775. 775. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 777. 778. 778. 781. 781. 781. 781. 781. 782. 782. 782. 782. 784. 784. 785. 785. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 786. 787. 787. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 797. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 799. 806. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 809. 831. 831. 831. 831. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 835. 835. 835. 835. 835. 835. 835. 835. 835. 835. 835. 835. 836. 836. 836. 836. 836. 836. 836. 836. 836. 836. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837. 837.1085.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1119.1121.1121.1121.1121.1122.1122.1123.1123.1123.1123.1123.1123.1123.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1135.1136.1140.1140.1140.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1179.1182.1182.1182.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1183.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1185.1186.1186.1186.1186.1186.1186.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1188.1195.1195.1196.1196.1196.1196.1196.1196.1196.1196.1196.1196.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1197.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1211.1212.1212.1212.1212.1212.1212.1212.1212.1224.1224.1224.1224.1227.1227.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1231.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1232.1233.1233.1233.1233.1234.1234.1234.1234.1235.1281.1281.1281.1281.1285.1288.1288.1288.1288.1288.1289.1289.1289.1289.1289.1289.1289.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1290.1292.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1295.1296.1296.1296.1296.1296.1296.1296.1299.1299.1300.1300.1300.1300.1300.1305.1306.1306.1306.1306.1306.1307.1307.1307.1308.1308.1308.1309.1310.1310.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1311.1314.1314.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1315.1316.1316.1317.1317.1317.1317.1317.1317.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1318.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.1319.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 28m15.512s user 28m10.465s sys 0m0.376s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 39m58.249s user 39m55.347s sys 0m0.078s