Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m1.542s user 0m0.302s sys 0m0.127s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:2181 spheres. 88. 88. 88. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 90. 92. 92. 92. 92. 93. 93. 93. 93. 93. 93. 93. 93. 97. 97. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 99. 102. 104. 105. 105. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 108. 108. 108. 108. 108. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 109. 113. 113. 113. 113. 113. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 114. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 116. 118. 118. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 124. 129. 132. 132. 132. 132. 132. 132. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 134. 136. 136. 136. 136. 136. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 140. 210. 210. 211. 216. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 218. 218. 218. 218. 218. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 220. 220. 220. 220. 220. 220. 220. 220. 220. 221. 221. 221. 222. 222. 222. 222. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 224. 225. 225. 225. 225. 226. 226. 226. 226. 231. 231. 231. 231. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 234. 234. 234. 234. 234. 234. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 236. 237. 237. 239. 244. 244. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 245. 247. 250. 250. 250. 250. 250. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 251. 252. 252. 258. 258. 258. 259. 259. 259. 259. 259. 259. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 260. 264. 265. 265. 265. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 266. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 267. 271. 271. 271. 272. 272. 272. 272. 272. 272. 272. 272. 272. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 274. 275. 275. 275. 275. 277. 281. 281. 281. 281. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 282. 283. 283. 283. 286. 286. 287. 287. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 288. 289. 289. 289. 289. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 293. 293. 293. 293. 293. 296. 296. 297. 297. 297. 297. 297. 299. 299. 299. 299. 299. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 306. 306. 306. 306. 311. 312. 312. 312. 312. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 313. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 314. 315. 315. 315. 315. 315. 315. 316. 317. 317. 317. 317. 317. 317. 318. 318. 322. 322. 322. 322. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 325. 326. 326. 326. 326. 326. 326. 326. 327. 327. 327. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 333. 334. 334. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 341. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 342. 349. 349. 349. 349. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 352. 561. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 564. 566. 566. 566. 566. 566. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 568. 571. 571. 572. 572. 572. 572. 573. 573. 573. 578. 578. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 581. 586. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 591. 592. 592. 592. 592. 592. 592. 592. 594. 594. 594. 594. 594. 598. 598. 600. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 601. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 605. 605. 605. 605. 605. 607. 622. 622. 623. 623. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 624. 626. 626. 626. 626. 626. 626. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 631. 632. 632. 632. 632. 632. 632. 632. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 645. 645. 645. 645. 645. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 656. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 658. 658. 658. 658. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 661. 664. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 665. 744. 746. 746. 746. 746. 746. 746. 746. 746. 746. 746. 746. 746. 749. 750. 750. 750. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 754. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 756. 764. 764. 764. 766. 768. 768. 768. 768. 768. 768. 768. 768. 771. 772. 772. 772. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 773. 774. 774. 777. 777. 777. 777. 779. 779. 779. 784. 784. 784. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 785. 786. 789. 789. 789. 789. 789. 789. 789. 789. 789. 789. 791. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 870. 870. 870. 871. 871. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 873. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 874. 881. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 887. 890. 890. 890. 890. 890. 890. 890. 891. 892. 894. 894. 894. 894. 894. 899. 899. 899. 900. 900. 900. 900. 900. 901. 901. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 902. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 908. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 909. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 910. 911. 921. 924. 925. 925. 926. 926. 926. 926. 926. 926. 928. 933. 933. 935. 936. 936. 938. 942. 943. 943. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 944. 948. 948. 948. 948. 948. 949. 949. 949. 951. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952. 952.1091.1091.1091.1093.1093.1093.1122.1123.1123.1123.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1124.1480.1482.1482.1482.1482.1482.1482.1482.1482.1482.1482.1509.1509.1509.1509.1509.1509.1509.1509.1509.1509.1516.1516.1517.1517.1517.1517.1517.1517.1518.1518.1520.1520.1520.1520.1520.1523.1523.1523.1523.1523.1524.1524.1524.1524.1524.1524.1524.1525.1525.1525.1525.1525.1525.1525.1525.1526.1526.1526.1526.1527.1527.1527.1527.1527.1527.1527.1527.1527.1529.1532.1532.1532.1533.1533.1534.1534.1534.1534.1534.1534.1534.1534.1534.1534.1534.1535.1535.1535.1543.1543.1543.1543.1548.1548.1548.1548.1550.1550.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1551.1553.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1556.1557.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1558.1559.1559.1559.1559.1559.1559.1562.1564.1564.1564.1564.1564.1564.1564.1564.1564.1566.1566.1566.1566.1566.1566.1566.1566.1566.1566.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1568.1569.1569.1569.1569.1569.1569.1569.1569.1569.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1570.1571.1571.1571.1571.1571.1571.1573.1573.1573.1576.1576.1577.1577.1579.1582.1584.1584.1585.1585.1585.1585.1585.1585.1585.1586.1586.1586.1586.1586.1586.1587.1587.1587.1587.1587.1587.1587.1588.1588.1588.1588.1588.1588.1590.1590.1590.1593.1593.1593.1594.1595.1595.1595.1595.1595.1595.1595.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1596.1597.1597.1597.1597.1597.1597.1597.1597.1597.1597.1597.1599.1601.1601.1601.1601.1601.1601.1601.1603.1603.1603.1603.1603.1603.1603.1603.1603.1603.1603.1604.1604.1604.1606.1606.1606.1606.1607.1608.1608.1608.1608.1608.1608.1608.1608.1608.1608.1608.1608.1611.1613.1613.1613.1613.1615.1618.1620.1621.1621.1621.1621.1621.1621.1622.1622.1622.1622.1623.1623.1623.1623.1630.1630.1630.1630.1630.1630.1649.1649.1649.1649.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1652.1652.1652.1653.1653.1653.1653.1653.1653.1653.1653.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1655.1656.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1657.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1659.1660.1660.1660.1661.1661.1661.1661.1661.1661.1661.1661.1661.1661.1661.1661.1662.1662.1662.1665.1665.1665.1665.1665.1665.1665.1665.1665.1667.1667.1667.1669.1671.1671.1674.1674.1674.1675.1675.1675.1675.1675.1675.1675.1676.1676.1676.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1677.1678.1678.1678.1678.1678.1678.1678.1678.1682.1682.1682.1682.1682.1682.1682.1682.1688.1689.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1694.1715.1721.1721.1721.1745.1750.1750.1750.1750.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 17m57.263s user 17m3.053s sys 0m0.070s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 27m48.984s user 24m11.408s sys 0m0.079s