Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m1.833s user 0m0.341s sys 0m0.120s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1822 spheres. 149. 149. 149. 149. 149. 150. 150. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 152. 154. 154. 154. 156. 156. 156. 156. 158. 158. 158. 158. 158. 158. 158. 158. 158. 159. 159. 159. 159. 159. 159. 159. 160. 160. 160. 160. 160. 165. 165. 165. 165. 165. 166. 167. 169. 169. 169. 172. 172. 172. 172. 172. 175. 175. 175. 175. 175. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 193. 195. 195. 198. 198. 198. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 200. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 205. 205. 206. 206. 206. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 207. 208. 208. 208. 208. 208. 208. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 209. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 212. 212. 212. 213. 213. 214. 214. 214. 214. 214. 215. 215. 215. 215. 215. 215. 216. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 219. 220. 220. 222. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 223. 224. 224. 225. 225. 225. 225. 225. 225. 225. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 227. 228. 228. 228. 230. 230. 230. 230. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 234. 234. 234. 234. 234. 234. 234. 234. 236. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 237. 239. 239. 239. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 242. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 252. 252. 252. 252. 253. 256. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 257. 261. 261. 261. 261. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 266. 531. 531. 534. 534. 534. 534. 534. 535. 535. 535. 535. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 537. 573. 573. 573. 573. 573. 573. 573. 573. 574. 574. 574. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 577. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 584. 584. 584. 584. 585. 585. 585. 585. 586. 586. 586. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 587. 589. 589. 592. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 593. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 594. 595. 595. 595. 595. 598. 602. 602. 602. 602. 607. 607. 607. 610. 610. 610. 610. 610. 610. 610. 611. 611. 614. 614. 614. 614. 618. 618. 619. 619. 619. 619. 619. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 630. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 633. 633. 633. 633. 636. 636. 636. 637. 637. 637. 637. 637. 637. 638. 638. 638. 638. 638. 638. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 639. 640. 640. 640. 640. 641. 641. 642. 642. 642. 642. 642. 642. 642. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 655. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 657. 658. 658. 658. 658. 658. 658. 658. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 659. 670. 670. 670. 671. 671. 671. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 672. 673. 673. 673. 673. 673. 674. 674. 674. 674. 674. 674. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 675. 676. 676. 676. 676. 676. 676. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 677. 678. 678. 678. 679. 679. 679. 679. 679. 679. 679. 680. 682. 682. 685. 685. 685. 687. 688. 695. 697. 697. 697. 697. 697. 700. 700. 700. 700. 700. 700. 700. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 701. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 702. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 703. 704. 704. 704. 704. 749. 749. 749. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 751. 751. 785. 785. 785. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 787. 966. 966. 966. 966. 966. 967. 968. 968. 968. 968. 968. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 969. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 970. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 971. 975. 978. 978. 978. 978. 978. 978. 978. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 979. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 980. 983. 983. 983. 984. 985. 985. 985. 985. 985. 986. 986. 986. 986. 986. 986. 986. 986. 987. 987. 987. 991. 993. 993. 993. 993. 993. 994. 994. 994. 994. 994. 996. 996. 996. 996. 999. 999. 999. 999. 999. 999. 999. 999.1000.1001.1001.1001.1001.1001.1001.1001.1001.1001.1001.1001.1001.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1002.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1004.1006.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1009.1010.1010.1010.1010.1010.1010.1010.1010.1010.1012.1012.1012.1012.1012.1012.1012.1012.1012.1012.1012.1012.1013.1013.1013.1013.1013.1013.1013.1013.1018.1018.1018.1018.1019.1020.1021.1021.1021.1021.1023.1023.1024.1024.1026.1026.1026.1026.1026.1026.1026.1026.1026.1026.1026.1027.1027.1027.1028.1051.1051.1051.1051.1051.1051.1058.1058.1058.1058.1059.1059.1059.1060.1060.1060.1060.1060.1060.1060.1060.1060.1063.1064.1064.1065.1065.1065.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1067.1071.1071.1071.1071.1071.1072.1072.1072.1072.1075.1075.1075.1077.1077.1077.1078.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1080.1081.1081.1082.1082.1082.1082.1082.1082.1082.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1083.1084.1084.1084.1084.1084.1084.1084.1084.1084.1085.1085.1085.1085.1085.1085.1085.1085.1085.1085.1089.1089.1089.1089.1090.1090.1090.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1091.1092.1092.1092.1092.1092.1092.1092.1092.1092.1092.1092.1093.1093.1093.1093.1093.1093.1093.1098.1098.1100.1100.1100.1100.1100.1100.1100.1100.1101.1101.1101.1101.1101.1101.1101.1101.1101.1101.1101.1101.1102.1102.1102.1102.1102.1102.1102.1123.1135.1135.1139.1388.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1395.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1396.1400.1400.1400.1400.1401.1401.1401.1401.1401.1402.1402.1402.1402.1402.1406.1406.1407.1407.1408.1408.1408.1408.1408.1408.1408.1412.1412.1412.1412.1413.1413.1413.1413.1413.1413.1413.1413.1413.1413.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.1419.2156.2156.2156.2156.2157.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2160.2162.2162.2162.2162.2169.2170.2170.2170.2170.2170.2170.2170.2170.2171.2171.2171.2171.2171.2171.2171.2171.2173.2173.2175.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2176.2177.2178.2178.2178.2178.2178.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2184.2185.2185.2185.2185.2187.2187.2187.2187.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 26m51.002s user 24m10.369s sys 0m0.072s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 42m42.879s user 34m32.300s sys 0m0.081s