Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m1.556s user 0m0.258s sys 0m0.158s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:1621 spheres. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 1. 3. 3. 4. 4. 5. 5. 5. 6. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 7. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 8. 10. 10. 10. 10. 10. 10. 10. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 13. 22. 22. 22. 22. 24. 58. 60. 61. 61. 61. 61. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 63. 73. 73. 73. 75. 75. 75. 75. 75. 75. 101. 101. 101. 105. 105. 105. 105. 105. 105. 105. 105. 105. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 106. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 107. 114. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 115. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 120. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 121. 122. 122. 122. 124. 127. 128. 128. 128. 128. 128. 128. 128. 128. 128. 128. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 129. 134. 134. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 136. 137. 137. 137. 137. 137. 137. 137. 137. 137. 137. 137. 142. 142. 142. 143. 143. 143. 143. 143. 143. 143. 145. 145. 145. 145. 145. 145. 145. 145. 146. 146. 146. 146. 148. 148. 148. 148. 148. 148. 148. 149. 150. 154. 154. 155. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 157. 158. 158. 158. 158. 158. 158. 158. 158. 165. 165. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 166. 168. 168. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 171. 172. 172. 172. 172. 173. 173. 173. 174. 174. 174. 174. 174. 178. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 179. 181. 181. 181. 181. 181. 181. 181. 181. 181. 181. 181. 182. 186. 186. 186. 186. 186. 186. 186. 189. 190. 190. 192. 192. 194. 194. 194. 194. 195. 195. 195. 195. 195. 195. 195. 195. 195. 196. 196. 196. 196. 196. 196. 199. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 201. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 203. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 206. 207. 207. 207. 207. 207. 208. 208. 208. 209. 209. 209. 209. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 210. 211. 216. 216. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 217. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 220. 220. 220. 220. 220. 220. 220. 220. 221. 221. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 222. 227. 228. 229. 229. 229. 229. 229. 229. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 230. 232. 232. 232. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 235. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 241. 242. 242. 242. 242. 244. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 247. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 248. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 249. 250. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 252. 253. 258. 258. 258. 258. 258. 258. 258. 258. 258. 258. 259. 259. 259. 259. 260. 260. 260. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 264. 270. 270. 270. 275. 275. 275. 275. 275. 275. 275. 275. 275. 276. 277. 277. 281. 281. 281. 281. 282. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 284. 285. 285. 285. 285. 285. 285. 287. 287. 289. 292. 292. 292. 292. 292. 292. 292. 292. 292. 293. 293. 293. 293. 293. 293. 294. 294. 296. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 301. 302. 302. 302. 302. 302. 302. 305. 305. 305. 305. 308. 308. 308. 308. 308. 308. 308. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 309. 311. 311. 312. 456. 457. 462. 481. 481. 481. 481. 481. 481. 481. 481. 481. 483. 484. 484. 484. 484. 488. 490. 490. 490. 490. 490. 492. 492. 492. 495. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 496. 498. 498. 498. 498. 498. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 500. 525. 544. 544. 544. 544. 544. 544. 545. 545. 545. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 571. 573. 573. 574. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 575. 576. 576. 576. 576. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 578. 579. 579. 579. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 580. 582. 584. 592. 592. 592. 592. 592. 592. 592. 592. 592. 741. 741. 741. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 750. 752. 755. 755. 755. 755. 755. 755. 755. 755. 755. 755. 757. 757. 757. 760. 760. 766. 766. 766. 766. 766. 766. 766. 766. 766. 766. 766. 768. 768. 768. 768. 768. 768. 770. 773. 773. 773. 774. 775. 777. 777. 777. 779. 779. 779. 779. 779. 779. 779. 779. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 792. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 793. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 794. 795. 833. 833. 833. 833. 833. 833. 848. 848. 848. 848. 848. 848. 848. 848. 848. 848. 849. 849. 849. 865. 865. 865. 865. 869. 870. 870. 870. 870. 872. 872.1894.1894.1901.1903.1903.1903.1904.1904.1904.1904.1905.1905.1905.1905.1905.1905.1905.1908.1908.1908.1908.1908.1908.1908.1908.1908.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1914.1915.1916.1916.1916.1916.1916.1918.1918.1918.1918.1918.1918.1918.1918.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1921.1922.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1923.1927.1927.1930.1930.1930.1930.1930.1930.1930.1930.1930.1930.1931.1931.1931.1931.1931.1931.1931.1931.1931.1933.1938.1938.1938.1938.1938.1939.1939.1939.1939.1939.1939.1940.1941.1942.1943.1943.1943.1943.1943.1943.1943.1943.1943.1943.1943.1944.1946.1946.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1947.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1948.1955.1955.1956.1956.1956.1956.1957.1957.1958.1958.1958.1958.1958.1958.1958.1958.1958.1958.1958.1959.1959.1959.1959.1959.1959.1959.1961.1961.1961.1961.1961.1961.1961.1961.1961.1961.1961.1963.1963.1963.1964.1964.1964.1967.1968.1968.1979.1979.1979.1979.2076.2076.2076.2076.2076.2076.2076.2079.2079.2079.2079.2079.2079.2079.2079.2079.2081.2081.2081.2081.2081.2081.2081.2081.2082.2082.2082.2083.2083.2086.2086.2086.2086.2086.2090.2092.2092.2092.2092.2092.2092.2092.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.2104.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 14m58.110s user 14m55.855s sys 0m0.118s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 21m15.862s user 21m13.013s sys 0m0.168s