Creating binding-site residue list Creating molecular surface real 0m3.409s user 0m0.557s sys 0m0.500s Creating sphgen spheres Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 0:2274 spheres. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 67. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 69. 73. 73. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 77. 81. 81. 81. 81. 81. 81. 81. 81. 81. 85. 85. 88. 89. 90. 90. 90. 90. 91. 92. 92. 92. 92. 92. 92. 92. 92. 92. 92. 92. 92. 94. 94. 94. 94. 94. 94. 94. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 98. 99. 99. 101. 101. 101. 101. 101. 102. 105. 105. 105. 105. 105. 105. 106. 109. 109. 109. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 117. 121. 121. 121. 121. 201. 201. 201. 216. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 218. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 232. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 233. 238. 240. 240. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 250. 251. 252. 252. 256. 256. 256. 256. 256. 256. 256. 256. 256. 256. 256. 256. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 261. 262. 262. 262. 262. 262. 262. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 263. 265. 265. 265. 265. 265. 265. 265. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 268. 272. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 273. 277. 277. 278. 280. 280. 280. 280. 280. 280. 282. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 283. 284. 284. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 290. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 295. 296. 296. 296. 296. 296. 296. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 297. 298. 298. 300. 300. 302. 302. 302. 302. 306. 317. 317. 317. 317. 317. 317. 317. 317. 324. 324. 324. 324. 324. 324. 343. 343. 343. 343. 343. 343. 372. 372. 372. 372. 377. 377. 377. 379. 379. 379. 379. 379. 379. 379. 379. 379. 380. 382. 383. 383. 383. 383. 383. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 388. 389. 389. 389. 389. 389. 389. 389. 389. 399. 399. 402. 402. 402. 404. 404. 404. 404. 404. 404. 404. 404. 404. 404. 404. 406. 406. 406. 406. 406. 407. 407. 411. 411. 411. 411. 411. 411. 412. 415. 416. 417. 417. 419. 419. 419. 421. 422. 422. 423. 423. 423. 425. 425. 427. 428. 428. 428. 428. 428. 428. 431. 434. 436. 436. 436. 436. 436. 436. 436. 436. 436. 437. 437. 437. 437. 437. 437. 437. 437. 438. 438. 438. 442. 442. 442. 442. 442. 444. 444. 445. 445. 445. 445. 445. 445. 445. 445. 445. 445. 445. 563. 563. 568. 568. 568. 568. 568. 569. 570. 570. 575. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 576. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 583. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 584. 586. 586. 586. 586. 586. 586. 588. 588. 588. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 589. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 590. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 591. 592. 592. 592. 592. 593. 593. 593. 594. 594. 594. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 595. 598. 598. 598. 599. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 603. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 605. 606. 606. 606. 606. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 607. 609. 609. 609. 609. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 612. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 613. 618. 618. 618. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 620. 622. 623. 623. 623. 623. 628. 628. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 629. 630. 630. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 631. 637. 637. 638. 638. 638. 638. 638. 638. 638. 638. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 643. 644. 644. 644. 647. 647. 647. 647. 648. 648. 648. 648. 648. 776. 776. 776. 776. 776. 776. 776. 776. 776. 776. 777. 777. 786. 786. 786. 787. 787. 787. 787. 797. 797. 797. 797. 797. 797. 803. 805. 805. 805. 805. 811. 811. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 818. 819. 819. 820. 820. 820. 822. 825. 825. 828. 828. 828. 828. 828. 828. 828. 828. 828. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 829. 831. 831. 831. 831. 838. 838. 838. 838. 838. 841. 841. 841. 841. 841. 841. 841. 841. 841. 841. 841. 841. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 846. 848. 848. 848. 848. 849. 849. 849. 853. 853. 853. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 854. 855. 855. 855. 855. 855. 860. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 864. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 866. 867. 871. 871. 874. 874. 874. 874. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 875. 877. 877. 877. 877. 877. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 879. 880. 880. 880. 880. 880. 880. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 882. 883. 883. 883. 885. 885. 885. 887. 887. 887. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 888. 906. 906. 906. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 907. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 908. 910. 911. 911. 911. 911. 911. 911. 911. 911. 912. 912. 912. 912. 912. 912. 912. 912. 916. 916. 916. 918. 918. 918. 918. 918. 918. 926. 926. 926. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 927. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 934. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 938. 940. 940. 941. 942. 942. 942. 942. 942. 942. 942. 942. 942. 942. 942. 945. 945. 946. 946. 946. 948. 948. 948. 948. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 950. 980. 980. 982. 982. 982. 982. 982. 982. 982. 982. 982. 983. 984. 984. 984. 984. 984. 984. 984. 984. 984. 985. 985. 985. 985. 985. 985. 985. 985. 985. 986. 986. 986. 986. 986. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 987. 998. 998. 998. 998. 998. 998. 998. 998. 998. 999. 999. 999. 999.1000.1000.1000.1000.1193.1193.1193.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1444.1446.1446.1446.1446.1446.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1448.1449.1449.1449.1449.1449.1449.1449.1606.1606.1606.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1607.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1622.1626.1626.1626.1626.1626.1626.1632.1632.1632.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1633.1635.1635.1635.1635.1635.1635.1636.1637.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1638.1644.1644.1644.1644.1644.1644.1644.1644.1644.1644.1649.1649.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1651.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1652.1653.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1654.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1656.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.1669.2159.2159.2159.2159.2161.2161.2163.2163.2163.2163.2163.2163.2163.2163.2163.2163.2163.2163.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2164.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2165.2167.2169.2169.2169.2169.2169.2169.2169.2169.2169.2169.2170.2170.2170.2170.2170.2170.2172.2173.2173.2173.2173.2177.2177.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2179.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2180.2181.2181.2181.2181.2181.2181.2181.2183.2183.2183.2183.2183.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2186.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2187.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2188.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2204.2208.2208.2208.2208.2208.2208.2208.2208.2208.2208.2208.2208.2209.2209.2209.2209.2209.2209.2221.2221.2221.2221.2222.2222.2222.2222.2222.2222.2222.2222.2222.2222.2222.2224.2224.2224.2224.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2234.2240.2240.2240.2240.2240.2240.2240.2240.2240.2240.2240.2246.2246.2246.2246.2246.2263.2735.2735.2735.2735.2735.2735.2735.2735.2735.2736.2736.2736.2736.2736.2736.2736.2736.2736.2736.2737.2737.2737.2737.2737.2737.2737.2737.2737.2737.2737.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.2739.FORTRAN STOP Generating faster matching2 spheres for docking Enter name of sphere cluster file: Enter cluster number to process (<0 = all): Generate surfaces as well as pdb files (/Y)? Enter name for output PDB file name: Cluster 1: 45 spheres. 9001.9002.9003.9004.9005.9006.9007.9008.9009.9010.9011.9012.9013.9014.9015.9016.9017.9018.9019.9020.9021.9022.9023.9024.9025.9026.9027.9028.9029.9030.9031.9032.9033.9034.9035.9036.9037.9038.9039.9040.9041.9042.9043.9044.9045.FORTRAN STOP Coloring matching spheres Creating box around spheres Hydrogen solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 26m12.780s user 26m10.742s sys 0m0.257s Heavy solvent excluded grid being made FORTRAN STOP real 35m14.197s user 35m13.219s sys 0m0.291s